Принцип действия септика с насосом аналогичен принципу действия самотечного септика. И основан на механических процессах отстаивания и биоочистки. С той лишь разницей, что септик с насосом устанавливается на участках с высоким уровнем грунтовых вод. Автоматически включающийся насос (при помощи поплавкового включателя) позволяет избежать затопление септика:

• Сточная вода из жилого дома по канализационным трубам самотеком поступает в первую зону (А), где задерживаются жиры, плавающие пленки, не осаждаемые частицы и поверхностно-активные вещества. Твердые вещества, попавшие со сточной водой и способные оседать, скапливаются на дне в виде осадка.
• Из первой зоны (А) сточные воды поступают во вторую зону (Б) септика, где происходит первичное осаждение хлопьев, полученных в результате жизнедеятельности микроорганизмов (бактерий). Переливное отверстие расположено ниже уровня зеркала воды, что позволяет в полной мере использовать его стабильное состояние для наращивания колонии бактерий.
• После прохождения второй зоны (Б) септика сточные воды через дренажные отверстия поступают в третью зону (В) септика. При прохождении блокиратора, хлопья полученные во второй зоне и не выпавшие в осадок, уплотняются и выпадают в осадок в виде мелкодисперсной взвеси во третьей зоне септика. Органические соединения, перешедшие в ходе анаэробных процессов из растворенного состояния во взвешенное, также выпадают в осадок.
• При достижении водой уровня дренажного насоса (Н), находящегося в третьей зоне (В), срабатывает поплавковый включатель, запускающий автоматическую откачку очищенной воды из септика.

Очистка хозяйственно-бытовых сточных вод в станции происходит следующим образом: Сточные воды самотеком из дома по входящему трубопроводу поступают в первую зону (А). В нижней части, которого находится мелкопузырчатый аэратор (Д1), подающий воздух для создания аэробных условий очистки сточных вод:

• На этом этапе механизм очищения базируется на биологическом процессе удаления загрязняющих веществ с помощью активного ила. На этапе обогащения стока кислородом загрязняющие субстанции частично трансформируются в воду и углекислый газ, а большей частью используются бактериями для роста и умножения. В результате этого процесса уничтожается большая часть загрязняющих органических соединений, и стимулируются реакции для очистки азотной фракции.
• Основная масса ила это органические, биоразлагаемые вещества, которые в процессе жизнедеятельности бактерий поглощаются им в пищу. Азот удаляется в два этапа, первый из которых определяется как нитрификация и выполняется в аэротанке, благодаря присутствию кислорода. В обработанном в первой зоне (А) стоке содержится аммиак, растворенные аммиачные соединения и продукты разложения протеинов, которые под воздействием кислорода оксидируются и трансформируются сначала в нитриты, а потом в нитраты. В осевшем на дно иле содержатся нитраты, которые на следующем этапе денитрификации будут восстановлены в газообразный азот, который не является загрязняющим веществом. Перемещенный из первой зоны (А) во вторую зону (Б) где, создаются условия для проведения денитрификации, с выделением азота и углекислого газа, которые освобождаются, не производя плохих запахов. Для отделения биопленки и окончательного осветления, очищенная вода поступает третью зону (В), оборудованную эрлифтом (Г), который удаляет осадок в приемную камеру. Из третьей зоны (В) очищенная вода принудительно удаляется при помощи дренажного насоса. Насос, оснащенный поплавковым включателем, реагирует на уровень воды в камере, и дает возможность избежать затопления станции.
• Очищенная сточная вода отводится за пределы станции в грунт (дренажный тоннель, колодец).